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在数学和抽象代数中，群论（英语：Group theory）研究名为群的代数结构。

群在抽象代数中具有基本的重要地位：许多代数结构，包括环、域和向量空间等可以看作是在群的基础上添加新的运算和公理而形成的。群的概念在数学的许多分支都有出现，而且群论的研究方法也对抽象代数的其它分支有重要影响。线性代数群和李群作为群论的分支，在经历了重大的发展之后，已经形成相对独立的研究领域。

用到的工具是 VCF2Dis

VCF2Dis：一种新的简单高效的软件，用于计算 p 距离矩阵和基于树的变体调用格式

工具对应的github主页 https://github.com/BGI-shenzhen/VCF2Dis

按照软件主页的帮助文档 下载安装，没有遇到问题

在用R语言做完图之后要想放在论文里，就需要把不同的图组合起来，尝试过用PPT，以及在Word里，效果都不太好，因此试着在R里组图（它的优势在于调图片清晰度比较方便）

jupyter notebook 安装中文字体解决可视化时部分字体不显示或者错位

WDL官网简介：

工作流描述语言（WDL）是一种开放标准，用于以人类可读可写的语法描述数据处理工作流。WDL 可以直接定义分析任务，在工作流中将它们连接起来，并并行执行。该语言力求让所有用户（包括程序员、分析师和生产系统的操作员）都能理解和使用。这种语言可以简单地表达常见的模式，如分散收集和条件执行。WDL 专为可移植性而设计，有多种实现方式可供选择，可在包括 HPC 系统和云平台在内的各种环境中运行。

jupyter安装教程

写在前面：

• window的分发很方便，适合做一些简单分析，简单的炼丹
• 一定要确保是wsl2下面按照linux子系统，wsl2较wsl提升巨大，具体可以百度。
• win10和win11都可以使用wsl安装子系统，个人感觉win11的powershell更好用
• 安装后修改默认mem,swap，修改安装路径（迁移子系统），创建交换目录文件夹
• 后续配置bashrc、安装conda、安装docker

在 Linux 中，锁定后台进程可以确保该进程在后台运行，即使当前用户退出登录或终端会话结束。这样可以保持进程的持续运行，而不受登录状态或终端连接的影响。

在 R 安装需要软件包时，”non-zero-exit” 错误通常指示程序在执行过程中出现了非零的退出代码。这通常表示程序在某个步骤中遇到了错误或异常情况。回溯安装过程，可以发现non-zero exit status 的问题不止一种，或者说所有的安装失败，都会给出 non-zero exit status 的warning。以下列出几种可能的问题类型，或许可以按照这些办法解决掉安装失败的问题。

One-hot 编码是一种将分类变量转换为二进制向量表示的编码方法。它常用于机器学习和数据分析中，特别是在处理分类特征时。在 One-hot 编码中，每个分类变量的每个可能取值都被表示为一个二进制向量的形式。这个二进制向量的长度等于分类变量的取值个数，其中只有一个元素为 1，其余元素都为 0。被编码为 1 的元素对应了分类变量的实际取值，而其他元素表示该分类变量的其他取值。